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干细胞在其他眼科疾病方面的研究和应用。青光眼作为视网膜神经节细胞进行性凋亡(或死亡)性疾病，在理论上存在着应用细胞替代疗法尤其是干细胞治疗的可能性。干细胞治疗青光眼可能的作用位点应位于视网膜神经节细胞、视乳头和小梁网：(1)目前大部分研究集中于视网膜神经节细胞的替代治疗，但目前移植后并没有得到预期的结构和功能的修复，同时也缺乏对细胞增殖、分化进行全程监控的手段。(2)小梁网细胞重建则主要是替代变性的巩膜-角膜细胞。(3)干细胞可能替代变性的视乳头细胞(主要是星形胶质细胞)或促进视神经髓鞘化。

肝脏主要由高度分化的肝细胞组成并完成许多任务，包括储存维生素和矿物质、去除毒素、调节血液中脂肪和糖。这些细胞的死亡后，由健康的新肝细胞取代。但这些新细胞的来源从来没有被确定。干细胞，能在补充保持自己数量的同时发展成高度分化的细胞，为皮肤，血液等组织在随着时间丢失细胞的时候提供新的细胞。但是，在肝脏中还没有发现过干细胞的存在。一些科学家推测，成熟的肝细胞可能通过分裂保持其数量。但Nusse博士说，肝脏成熟的细胞已经高度分化，它们可能已经失去了分裂能力。“分化过的肝细胞染色体已经放大，”他解释说，“这表明这些细胞的每一条染色体有超过两个副本。这保证细胞能产生更多的蛋白质，不过确实会损害了它们的分裂能力。”

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